יש נוסחים שונים לגבי עיתוי אמירת עלינו לשבח. לדוגמא: על פי נוסח אשכנז אומרים אחרי ובא לציון, ולפי נוסח ספרד אומרים אחריח אין כאלוקנו.  להלכה כל אחד יאמר על מי מנהגו.

לפי מנהג אשכנז אומרים "עלינו לשבח" ואחר כך שיר של יום. ומנהג ספרד אומרים קודם שיר של יום, פטום הקטורת, ולהסוף "עלינו." הנוהג כנוסח אחר ומתפלל במקום בו שליח הציבור נוהג כנוסח השני, חלוקות הדעות  בעניין זה כיצד ינהג,  מכל מקום, לא ישב בשעה שכל הציבור עומד  ב"עלינו לשבח" כדי לא להבליט את הבדלי הנוסח.